big_tableに記録されているmaster_idの一覧を表示する場合、単純にマスタと結合してDISTINCTをつけると、big_tableのフルスキャンが実行される。

select DISTINCT master_id, master_name from master_table join big_table using(master_id);

高速化のためには、fromに指定するのはmaster_tableのみにして、EXISTSを使う。
さらにbig_table.master_idにINDEXを付与する。

create index idx_big_table_master_id big_table(master_id);
select master_id, master_name from master_table m where EXISTS (select 1 from big_table b where m.master_id = b.master_id);

EXISTSを使用することでbig_tableの中で各master_idが一件でも見つかれば処理が終了することに加え、INDEXを使用してmaster_idを検索するため、高速化が見込める。
where句にbig_tableのmaster_id以外の条件(cond_a)が加わる場合、master_idのINDEXの代わりにmaster_idとcond_aの複合INDEXを作成することも考える。